Come per il suo predecessore Far-Cry, Crysis consentirà al giocatore di raggiungere gli obiettivi di una missione in diversi modi e senza alcuna restrizione di sorta. Sarà quindi possibile scegliere e portare avanti il proprio stile di gioco senza essere costretti a percorrere strade obbligatorie per terminare una missione.

Durante la sua permanenza nella giungla Nord Coreana il nostro protagonista Jake sarà in grado di modificare le armi a propria disposizione in modo da ottenere effetti devastanti in ogni situazione di gioco. Una grande importanza verrà ricoperta dalla tuta militare USA chiamata Nano Muscle Suit che consentirà a Jake di trasportare armi molto pesanti, incrementare la velocità di corsa, ridurre i danni ricevuti e saltare molto più in alto di un normale essere umano. Grazie anche alla rigenerazione automatica della salute, in Crysis non saranno presenti kit medici o bendaggi, avendo come unica risorsa da tenere sotto controllo la riserva energetica della Nano Muscle Suit.

Un altro importantissimo aspetto di Crysis sarà l'IA dei personaggi. Siano essi soldati amici o nemici saranno estremamente realistici nei loro comportamenti. Durante un combattimento utilizzeranno vere strategie militari, lavorando in squadra e adattandosi a qualsiasi situazione imprevista. I soldati saranno in oltre in grado di percepire i rumori causati dal giocatore ed intervenire di conseguenza. Al di fuori di uno scontro questi personaggi condurranno una vita estremamente realistica. Non sarà raro quindi osservare soldati parlare con i propri compagni, fumare, sbadigliare, salutare un ufficiale o pattugliare una zona.